斯洛維尼亞東北部的小村達那斯村住著少年克利羅和少女菲兒。戰爭的影子逼近，平穩的日常因爲德軍的侵入而消失殆盡。克利羅爲了尋找分散的大哥伊萬，加入了其參與的遊擊隊組織。然而，在偶然情況下再遇才知道，伊萬並非自己的親兄弟，是南斯拉夫和德國的混血兒，並且在為德國政府做情報工作。懷著心中的怒火，克利羅一邊苦惱困惑著暴力與和平一邊繼續參與戰鬥。另一方，菲兒被抓進集中營之後因爲長相酷似中校死去的妹妹而獲得一個免除勞動的機會。然而她並沒有爲此沉溺而是選擇再度回到集中營。在苦難中意識生死別離、平等尊嚴。
隨著故事的發展，克利羅與菲兒對現實有了新一番體會，而伊萬是以什麽立場做著雙面碟的工作也逐漸明朗……

20世紀末，英國頻繁發生吸血鬼事件。通稱「Hellsing機關」、專門殲滅反基督怪物的王立國教騎士團雖使出王牌吸血鬼阿爾卡特作出應對，仍無法避免連總部都被入侵，只好與非同道人的梵蒂岡及其直屬的法王廳特務局聯合。
另一方，潛伏在歷史陰影中的敵人也正在重整旗鼓，一連串不尋常的人造吸血鬼肆虐事件指向了一個秘密的組織「千禧年」， 這個組織由躲藏在南美的納粹殘黨所建立，在領導人少校的指揮之下，許多加入組織的黨衛軍老兵接受了改造成了不死的吸血鬼軍團「最後的大隊」，他們以消滅阿爾卡特以及Hellsing為目標，旨在毀滅英國，將無盡的戰火再度帶到這世界上……

從拜巴尼亞戰爭中隱身脫逃的日本逃兵天下太平，赫然搖身一變成為人工授精的實驗品。然而，經由他特異的精子所培育出來的後代，卻都是擁有第三性別的基因突變人種……

高中生吾妻晴被父親帶到肯亞，表面上是為了進行非洲草原旅遊心理治療，實際上父親卻想殺了他以領取保險金。然而阿晴並沒有死，他和作爲「曾經是萬物的一部分、所有生物的根源、毀滅一切使之前進的力量的意志統合體」的Will交換契約，成爲新人類Omega。在受到美國另一位次世代新人類伊芙的刺激之後，與巨大暴走族集團總長梶秋一成爲盟友，預定在三年之後以「祭典」為名發動政變。

我叫稻葉十吉，34歲，是個普通的上班族。現在正在新婚熱戀期！可是某天，我突然撞見殺手內訌的場面，一個叫「二丁」的頂尖殺手在死前要我冒充他去救他的女人……沒想到之後我就被逼必須過著表面是上班族，背地裡是殺手的雙重生活！！

高城一砂年幼喪母，由父親的朋友江田夫婦撫養成人。一天，一砂在給美術部的八重堅當模特時突然昏倒，然後就像被什麼東西指引著一樣回到了過去的家。在那裡他見到了自己的姐姐千砂，並從她那裡得知高城家的人都會得一種病——像吸血鬼一樣對別人的鮮血產生渴望。千砂失去了父親，並且得不到任何人的血液，只能憑藉藥物維持生命。後來一砂發現自己也患上了這種怪病，看著發病後痛苦萬分的一砂，千砂將自己流著血的手臂伸向了他……